Pour faire suite à son assemblée générale qui aura lieu jeudi 5 décembre matin à Toulouse, BioinfOmics organise des journées scientifiques sur le thème de la pangénomique, avec deux moments forts :
- le 5 décembre après-midi : une série d'exposés scientifiques accessibles à tous en visio (lien zoom et programme ci-dessous)
- le 6 décembre en présentiel : un atelier pratique
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Programme du 5 décembre 2024 :
Début | Fin | Prénom | Nom | Présentation |
Jeudi 5 décembre |
12:00 | 14:00 | | | Repas |
14:00 | 14:30 | Benjamin | Linard | Intro sur la pangénomique |
14:30 | 15:00 | Guillaume | Gautreau | La pangénomique des procaryotes |
15:00 | 15:30 | Jean | Monlong | La pangénomique en santé |
15:30 | 16:00 | | | Pause |
16:00 | 16:12 | Alexis | Mergez | Pan1c: un workflow Snakemake pour simplifier la construction et l'exploration de pangénomes |
16:12 | 16:24 | Ismaël | Blanchard | Retour d'expérience : pangénome sur arbre fruitier, abricotier |
16:24 | 16:36 | Baptiste | Pierre | Graphes pangénomiques et diversité de la vigne cultivée : Premières avancées dans l'exploration génomique ? |
16:36 | 16:48 | Valentin | Sorin | Construction of pangenomes in sheep and goats provide new insights into their genetic diversity |
16:48 | 17:00 | Maulana | Naji | Application of variation graph for genotyping structural variants in French cattle |
17:00 | 17:12 | Nina | Marthe | Transfert d'annotations dans des graphes de pangénome |
17:12 | 17:24 | Kiwoong | Nam | Highly polymorphic copy number variations of genes in Spodoptera frugiperda |
17:24 | 17:36 | Nadia | Ponts | Expression du pan-génome du complexe d'espèces du genre Fusarium responsable de la fusariose de l'épi de blé |
17:36 | 17:48 | Javier | Belinchon-Moreno | Exploring melon NLR Clusters in Pangenome Graphs: Limitations for GWAS and the Shift to Kmer-Based and Gene Presence/Absence Approaches |
17:48 | 18:00 | Yann | Bourgeois | Advances in the study of population dynamics of transposable elements and application to date palm genomics |
18:00 | 18:12 | Johann | Confais | The Brachypodium distachyon pangenome highlights Transposable Element dynamics in the species |
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