BioinfOmics, l'Infrastructure de Recherche INRAE en bioinformatique

 

BioinfOmics est une organisation distribuée qui répond aux besoins en bioinformatique des sciences de la vie, dans un contexte de production massive de données et de science ouverte.  L’un des objectifs consiste à porter les défis de la bioinformatique dans les domaines de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement pour une grande diversité d’espèces animales, de plantes et de microorganismes.

 

BioinfOmics constitue un acteur majeur au sein de l'infrastructure de recherche nationale de services en bioinformatique, l’IFB  (Institut Français de Bioinformatique) qui mutualise, soutient et coordonne le développement des plateformes de bioinformatique dépendant d’organismes publics de recherche.

 

L’offre de services de BioinfOmics intègre :

  • l’hébergement de comptes utilisateurs/projets via la mise à disposition d'une infrastructure informatique de calcul et stockage à l’échelle, environnée et dédiée, des logiciels et banques généralistes et spécialisées du domaine, un support aux utilisateurs.   
  • le développement et le déploiement de ressources innovantes telles que logiciels, banques de données et systèmes d’information.   
  • un accompagnement à la valorisation de données “omiques” par de nombreuses applications en génomique, en métagénomique autour des données issues du séquençage (assemblage et annotation de (méta)génomes, analyse de données (s) RNAseq, RNAseq de novo, methyl-seq,...), des services d’intégration de données en mobilisant des approches statistiques et/ou des environnements interopérables.
  • la diffusion d'un savoir-faire en bioinformatique à travers des cycles d’apprentissage, du tutorat, du conseil et de l'assistance aux utilisateurs.

 

BioinfOmics a bénéficié de financements du programme "Investissements d'Avenir via IFB".