Analyse de données omiques

Cours

Jour

Lieu de la formation

Présentiel

Distanciel

Jouy-en-Josas

Toulouse

Versailles

Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

1

Annotation automatique de génomes bactériens

1

TE detection and annotation using REPET package

2

Manuel curation of transposable elements reference sequences obtained with REPET pipelines

2

Comparaison de génomes microbiens

1

Alignement RNASeq, quantification et découverte de nouveaux transcrits avec l'analyse statistiques

3.5

Traitement bioinformatique et analyse différentielle de données d'expression RNA-seq sous Galaxy

3

Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées

2

Alignement de lecture courtes et recherche de variants

2

Modélisation in silico de structures 3D protéines. Prédiction de mutations, de fixation de ligands

2

Analyse de données de métabarcoding

4

Analyse de données métagénomiques "shotgun"

2

 

Ces modules nécessitent un nombre minimum d’apprenants pour avoir lieu (généralement 5 apprenants).

 

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