Analyse de données omiques

CoursJourLieu de la formation
Jouy-en-JosasToulouseVersailles
Analyse primaire de données NGS  sous Galaxy1

info

Annotation et comparaison de génomes bactériens2

info

TE detection and annotation using REPET package2

info

Manuel curation of transposable elements reference sequences obtained with REPET pipelines2

info

RNASeq : alignement, quantification et découverte de nouveaux transcrits avec l'analyse statistiques3.5

info

Traitement bioinformatique et analyse différentielle de données d'expression RNA-seq sous Galaxy3

info

Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées2

info

Alignement de lecture courtes et recherche de variants2

info

Modélisation in silico de structures 3D protéines. Prédiction de mutations, de fixation de ligands2

info

Analyse de données de métabarcoding4

info

Analyse de données métagénomiques "shotgun"2

info

 

Ces modules nécessitent un nombre minimum d’apprenants pour avoir lieu (généralement 5 apprenants).

 

BioinfOmics est à l’écoute de vos besoins additionnels de formation ou de vos besoins de former un collectif (équipe/unité), envoyer vos besoins à bioinfomics-codir at inrae.fr, toutefois, n’hésitez pas à consulter les autres offres de formation sur les sites de l’IFB ou de la SFBI.